Den anholdte er 60 år og fremstilles i et grundlovsforhør ved Retten i Odense senere torsdag.
Han og offeret er bekendte.
Søndag blev liget af den 39-årige arbejdsløse mand fundet nord for Siø mellem Langeland og Tåsinge.
Brian Thomas Andersen, der boede i Middelfart, blev efterlyst den 6. maj.
Siden fundet af liget har teknikere og efterforskere undersøgt sagen nærmere, og nu er der altså anholdt en mistænkt i sagen.
Politiet ønsker ikke at give flere oplysninger om sagen, fremgår det af en pressemeddelelse.
Anklageren vil kræve, at dommeren lukker dørene ved grundlovsforhøret.
Brian Thomas Andersen blev sidst set i live den 3. maj.
Politiet mener, at forbrydelsen blev begået netop den dag - men hvordan og hvorfor er der foreløbig ingen oplysninger om.
Betjente anholdt den 60-årige onsdag eftermiddag klokken 16.35, oplyser politiet til Ritzau.
/ritzau/
Seneste artikler
Skoleelever hyldet af byrådsmedlemmer
Russisk tv viser video fra helikopter-drama ud for Gedser
Fundet livløs i rabatten: Cyklist fløjet til Rigshospitalet
Renovering af stor p-plads rykker nærmere
Sætter ord på viral video: - Det var et sats
Mest læste artikler
Brand i sukkerfabrik
Tom bil på Farøbroen: Eftersøgning fortsætter mandag
Dramatisk: Traktor på afveje påkørte biler og ramte hus
Truede med at skyde bekendt: Fandt våben hos kvinde
Stjal 450.000 fra gymnastikfolk og tipsklub