Midtbanespilleren Franck Ribery bragte sydtyskerne foran i første halvleg, da franskmanden kom forrest på et indlæg fra højre.
Målmaskinen Mario Gómez fordoblede føringen, da den tyske angriber i to omgange fik skovlet bolden i mål kort inde i anden halvleg.
Dermed er Bayern München i semifinalen, mens William Kvist må nøjes med at koncentrere sig om ligaen resten af sæsonen.
Det var i det hele taget en skidt dag for danskerne i den tyske pokalturnerings kvartfinaler.
Tidligere onsdag røg også Hoffenheim med danske Jannik Vestergaard ud, da Bundesliga-klubben højst overraskende tabte 0-1 på hjemmebane til Greuther Fürth fra den næstbedste tyske række.
Hoffenheims nederlag kan forklares med et tidligt rødt kort, der banede vejen for Greuther Fürth. Vestergaard spillede hele kampen i forsvaret for Hoffenheim.
Også Mönchengladbach er videre til semifinalen, da holdet vandt 2-0 ude over Hertha Berlin. Begge mål blev scoret i forlænget spilletid, da den ordinære kamp endte 0-0.
Den tidligere FC København-spiller Oscar Wendt, som ikke har fået så meget spilletid i den tyske klub efter sommerens skifte fra FCK, scorede det andet mål i sejren i det 120. minut.
Dortmund er det fjerde og sidste hold, som er videre til semifinalerne. Dortmund vandt tirsdag 4-0 ude over Holstein Kiel.
/ritzau/
Seneste artikler
Vil du have indflydelse på de nye skoledistrikter? Her er fristen
Lokale vil have havbrug væk: – Vi bader i fedtemøg
Fejø manglede en læge – så kom der to
Føler de bliver druknet: Først var der ingen bilag – så kom der 16
Tyve fældet, da vildmarksbad selv slog alarm
Mest læste artikler
Brand i sukkerfabrik
Tom bil på Farøbroen: Eftersøgning fortsætter mandag
Fundet livløs i rabatten: Cyklist fløjet til Rigshospitalet
Stjal 450.000 fra gymnastikfolk og tipsklub
Truede med at skyde bekendt: Fandt våben hos kvinde