Blandt de dræbte er en soldat og en politimand, oplyser myndighederne til lokale medier.
Sammenstødet er det mest blodige af en række episoder i weekenden, hvor blandt andet en eksplosion ramte byen Kaduna i den nordlige del af landet, og en lokal embedsmand blev myrdet i den nordøstlige by Maiduguri.
Lørdag blev tre politistationer angrebet i den nordøstlige delstat Yobe. Her blev to dræbt, oplyser politiet.
De nye sammenstød kommer i kølvandet på et stadig mere voldeligt oprør, som Boko Haram står bag primært i den nordlige og overvejende muslimske del af landet.
Der er ingen tegn på, at konflikten er på vej til at nedtrappes på trods af sidste måneds forsøg på forhandlinger med regeringen.
Der har tidligere været mange lignende angreb, og over 1000 har mistet livet siden 2009.
- Sammenstødet, der dræbte 11, fandt sted i Okene-distriktet i delstaten Kate, der ligger i den centrale del af landet, efter soldater forsøgte at trænge ind i et formodet gemmested for oprørsgruppen, siger en talsmand for delstatens guvernør.
De nigerianske myndigheder er stadig på jagt efter flere, der formåede at flygte, da razziaen blev sat i gang.
Søndag forsøgte en mand at placere en bombe på en tankbil, men ombestemte sig undervejs. Bomben gik af for tidligt og dræbte bombemanden.
Boko Harams oprør har vakt stor bekymring i Nigeria, som er Afrikas mest folkerige nation og største olieproducent. Landet er delt mellem en hovedsagelig muslimsk nordlig del og en overvejende kristen sydlig del.
Boko Haram blev dannet i 2002 og har som mål at indføre en islamisk stat i Nigeria.
/ritzau/AFP
Seneste artikler
Nye krimier afslører landsdelens mørke hemmeligheder
Direktør langer ud efter havbrugskritikere: – De er direkte onde
Vil du have indflydelse på de nye skoledistrikter? Her er fristen
Lokale vil have havbrug væk: – Vi bader i fedtemøg
Fejø manglede en læge – så kom der to
Mest læste artikler
Brand i sukkerfabrik
Tom bil på Farøbroen: Eftersøgning fortsætter mandag
Fundet livløs i rabatten: Cyklist fløjet til Rigshospitalet
Stjal 450.000 fra gymnastikfolk og tipsklub
Truede med at skyde bekendt: Fandt våben hos kvinde