Mange af dem brændte op, da de blev fanget af flammerne i deres celler, oplyser myndighederne, der umiddelbart efter tragedien opgjorde dødstallet til omkring 200.
Overlevende indsatte beskylder fængselspersonalet for at være skyld i tragedien.
- Vi var ved at brænde ihjel og paniske, fordi de ikke ville åbne cellerne, da ilden bredte sig, siger en af de indsatte til de lokale medier.
Politiet undersøger flere teorier. Blandt andet om branden blev påsat som led i et flugtforsøg.
Pårørende til omkomne fanger stormede onsdag en sektion af det ødelagte fængsel for at vise deres vrede.
Fængslet ligger i byen Comayagua omkring 75 kilometer nord for hovedstaden.
En del fanger kom ud af fængslet ved at bryde gennem taget. Nogle benyttede lejligheden til at flygte.
- Der var tæt ved 900 indsatte i fængslet, og det frygtes, at mange af dem nu er på flugt, siger Hector Ivan Mejia, talsmand for landets sikkerhedsmyndigheder.
Lokale brandfolk siger, at de blev forhindret i at komme ind i fængslet på grund af skyderier. Men Daniel Orellana, leder for fængselsvæsnet i Honduras, afviser, at der var optøjer før branden.
I maj 2004 døde 107 fanger ved en brand i fængslet i San Pedro Sula.
Latinamerikanske fængsler er berygtede for at være overfyldte, særligt i fattige stater som Honduras i Mellemamerika. Der forekommer tit oprør og kampe mellem rivaliserende bander, der er knyttet til narkotikasmugling.
En del bander, der er kendt som "maras", er oprindeligt startet i USA og har derfra spredt sig ned gennem Centralamerika. Ifølge tal fra FN har Honduras den højeste drabsrate i verden.
/ritzau/AFP
Seneste artikler
Nye krimier afslører landsdelens mørke hemmeligheder
Direktør langer ud efter havbrugskritikere: – De er direkte onde
Vil du have indflydelse på de nye skoledistrikter? Her er fristen
Lokale vil have havbrug væk: – Vi bader i fedtemøg
Fejø manglede en læge – så kom der to
Mest læste artikler
Brand i sukkerfabrik
Tom bil på Farøbroen: Eftersøgning fortsætter mandag
Fundet livløs i rabatten: Cyklist fløjet til Rigshospitalet
Stjal 450.000 fra gymnastikfolk og tipsklub
Truede med at skyde bekendt: Fandt våben hos kvinde