Det har landets militære anklagemyndighed besluttet, oplyser en militær kilde til nyhedsbureauet AFP.
De 300, heriblandt også ni journalister, bliver varetægtsfængslet i 15 dage, mens myndighederne efterforsker urolighederne, der kostede to mennesker livet og kvæstede op mod 300 andre.
De tilbageholdte beskyldes blandt andet for at overfalde officerer og soldater fra hæren.
En kilde tilføjer, at der kan blive foretaget flere anholdelser på et senere tidspunkt.
Derimod blev det besluttet, at alle fængslede kvinder løslades. Militæret oplyser ikke, hvor mange det drejer sig om, men ifølge aktivister er det mellem 14 og 17.
Lørdag deltog Egyptens militære leder, feltmarskal Mohammed Hussein Tantawi, i begravelsesoptoget for den ene af de dræbte, som var medlem af en specialenhed inden for sikkerhedsstyrkerne.
Urolighederne brød ud, da grupper af demonstranter kastede sten mod de sikkerhedsstyrker, der bevogter forsvarsministeriet. Soldaterne svarede igen med vandkanoner og tåregas.
Egyptens militære magthavere opretholder det natlige udgangsforbud omkring ministeriet i et forsøg på at forhindre nye uroligheder.
Gadekampene kommer blot tre uger inden det første præsidentvalg i landet, efter at eneherskeren Hosni Mubarak blev tvunget fra magten i februar 2011.
Fredagens demonstration begyndte som en protest mod, at flere præsidentkandidater er blevet diskvalificeret fra det kommende præsidentvalg, og for at markere modstand mod den vold, der kostede 11 mennesker livet ved en anden demonstration onsdag.
/ritzau/AFP
Seneste artikler
Motorcyklist påkørte dødt dådyr
Trippel sportsfest: Her er søndagens kampe
Nye krimier afslører landsdelens mørke hemmeligheder
Direktør langer ud efter havbrugskritikere: – De er direkte onde
Vil du have indflydelse på de nye skoledistrikter? Her er fristen
Mest læste artikler
Tom bil på Farøbroen: Eftersøgning fortsætter mandag
Fundet livløs i rabatten: Cyklist fløjet til Rigshospitalet
Stjal 450.000 fra gymnastikfolk og tipsklub
Truede med at skyde bekendt: Fandt våben hos kvinde
Bostedet Langholt lukker