Det religiøse overhoved døde lørdag 88 år gammel efter længere tids sygdom.
Shenuda ligger på en båre iført ligklæder og guldkrone, mens religiøse koptiske sange fylder den store katedral i det centrale Kairo. Uden for kirken samles tusindvis af mennesker i bøn for at vise deres respekt over for den afdøde pave.
Ceremonien i kirken bliver ledet af patriarken af den ortodokse kirke i Etiopien, Abuna Paulos, som er fløjet ind fra Etiopiens hovedstad, Addis Ababa.
- Vi har ikke mistet ham, selvom han nu er død, siger Abuba Paulos ved begravelsen.
Ceremonien bliver vist live på tv, og billederne viser præster fra hele verden samt ministre, parlamentsmedlemmer og andre offentlige personer, som i gråd siger farvel til Shenuda.
Flere i menneskemængden uden for kirken har ventet hele natten for at deltage i begravelsesceremonien.
Tirsdag er blevet erklæret for national sørgedag for at markere lederen af Mellemøstens største kristne fællesskab.
Shenuda blev i 1971 udråbt til pave af Alexandria - byen der historisk var hovedsædet for den koptiske kirke.
Paven er det religiøse overhoved for alle koptere i Egypten, som udgør 10 procent af de 80 millioner egyptere.
Han blev i 1970'erne sat i husarrest af præsident Anwar Sadat efter at have kritiseret den egyptiske leder for at pleje nære forbindelser til islamister.
Men han støttede Sadats efterfølger, Hosni Mubarak, som blev fjernet sidste år af et folkeligt oprør.
/ritzau/AFP
Seneste artikler
Nye krimier afslører landsdelens mørke hemmeligheder
Direktør langer ud efter havbrugskritikere: – De er direkte onde
Vil du have indflydelse på de nye skoledistrikter? Her er fristen
Lokale vil have havbrug væk: – Vi bader i fedtemøg
Fejø manglede en læge – så kom der to
Mest læste artikler
Brand i sukkerfabrik
Tom bil på Farøbroen: Eftersøgning fortsætter mandag
Fundet livløs i rabatten: Cyklist fløjet til Rigshospitalet
Stjal 450.000 fra gymnastikfolk og tipsklub
Truede med at skyde bekendt: Fandt våben hos kvinde