Luxembourgeren fra Radioshack Nissan-Trek-holdet kørte fra frontgruppen på den 218 kilometer lange etape fra Verbania til Verbier, der sluttede med en opstigning.
På det sidste stykke blev Fränk Schleck overrumplet af Rui Costa fra Movistar-holdet, og portugiseren spurtede sig til sejren på etapen, der indeholdt to bjerge uden for kategori.
Chris Anker Sørensen fra Team Saxo Bank blev nummer syv på etapen.
Fränk Schleck var ellers ved at lukke munden på kritikerne, efter at han for et par uger siden trak sig ud af Giro d'Italia.
Det medførte verbalt mundhuggeri mellem ham og Radioshack Nissan-Trek-chefen Johan Bruyneel.
Bruyneels humør blev næppe bedre af, at Radioshack Nissan-Trek for anden dag i træk blev snydt for etapesejren.
På lørdagens 1. etape blev holdets tempospecialist, Fabian Cancellara fra Schweiz, besejret med fire sekunder af slovakken Peter Sagan fra Liquigas-holdet.
Peter Sagan måtte søndag slippe på den afsluttende stigning, og Rui Costa er ny mand i den gule førertrøje.
Fränk Schleck er nummer to, otte sekunder efter portugiseren.
3. etape bliver kørt mandag over 185 kilometer fra Martigny til Aarberg. Den indeholder visse stigninger, men slet ikke i samme kategori som på søndagens etape.
/ritzau/
Seneste artikler
50 liter narko i BMW’en: Tysk par får fængsel og udvises
Langholt slår igen mod tilsyn: Uenig i afgørelse
Købte dyre ejendomme og leasede luksusbiler: Derfor mister bosted sin godkendelse
Efter brandulykke: Sådan skal de ansatte hjælpes videre
Efter redegørelse: - Det kunne jeg have fundet på nettet
Mest læste artikler
Efter stor eftersøgning: Mand fundet livløs i vandet
Mand fundet død i Maribosøerne
DMI udsender varsel
Kommune hjemsender omstridt centerchef
Efter 69 år: Vil rive gigantisk vartegn ned